Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRHP20396 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRHP20396 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRHP20396 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRHP20396 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRHP20396 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRHP20396 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRHP20396 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRHP20396 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRHP20396 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRHP20396 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRHP20396 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms