Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AMY2BP19961 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMY2BP19961 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms