Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD53P19397 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD53P19397 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD53P19397 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD53P19397 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms