Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF3P18847 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF3P18847 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF3P18847 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF3P18847 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF3P18847 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF3P18847 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF3P18847 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATF3P18847 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATF3P18847 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF3P18847 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF3P18847 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms