Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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PTPRAP18433 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRAP18433 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTPRAP18433 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRAP18433 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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