Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DESP17661 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DESP17661 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DESP17661 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DESP17661 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms