Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB4P17483 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms