Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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