Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGAP10645 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGAP10645 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHGAP10645 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHGAP10645 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHGAP10645 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHGAP10645 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHGAP10645 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHGAP10645 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHGAP10645 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHGAP10645 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHGAP10645 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHGAP10645 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHGAP10645 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHGAP10645 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHGAP10645 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHGAP10645 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHGAP10645 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHGAP10645 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms