Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L5P0DN76 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L5P0DN76 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms