Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APELAP0DMC3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms