Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA1P0DJI8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms