Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSD2O96028 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSD2O96028 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSD2O96028 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NSD2O96028 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms