Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF6O75683 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF6O75683 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF6O75683 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SURF6O75683 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SURF6O75683 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SURF6O75683 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SURF6O75683 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SURF6O75683 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SURF6O75683 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SURF6O75683 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SURF6O75683 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms