Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM4AO75164 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms