Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms