Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELL2O00472 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELL2O00472 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELL2O00472 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELL2O00472 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELL2O00472 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELL2O00472 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELL2O00472 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELL2O00472 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELL2O00472 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELL2O00472 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELL2O00472 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELL2O00472 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELL2O00472 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELL2O00472 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELL2O00472 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELL2O00472 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ELL2O00472 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELL2O00472 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ELL2O00472 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELL2O00472 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELL2O00472 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELL2O00472 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELL2O00472 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELL2O00472 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELL2O00472 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELL2O00472 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ELL2O00472 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELL2O00472 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELL2O00472 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELL2O00472 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELL2O00472 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELL2O00472 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELL2O00472 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELL2O00472 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELL2O00472 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms