Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP23O00161 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms