Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGPEP1LA6NFU8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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