Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms