Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS37CA5D8V6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms