Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMB4A4D0S4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMB4A4D0S4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms