Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC5DA1L4H1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC5DA1L4H1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms