Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
A0A0J9YXV3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms