Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAX2Q9UIW0 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms