Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEMA3BQ13214 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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