Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms