Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SENP3Q9H4L4 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SENP3Q9H4L4 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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