Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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