Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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PDCD1Q15116 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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PDCD1Q15116 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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PDCD1Q15116 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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PDCD1Q15116 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDCD1Q15116 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDCD1Q15116 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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