Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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RAB39AQ14964 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB39AQ14964 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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RAB39AQ14964 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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RAB39AQ14964 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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RAB39AQ14964 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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RAB39AQ14964 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RAB39AQ14964 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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