Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-0.71□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.71□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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