Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PCSK1P29120 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms