Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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FOXQ1Q9C009 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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FOXQ1Q9C009 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXQ1Q9C009 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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