Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SIGMAR1Q99720 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms