Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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