Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SAMD1Q6SPF0 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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