Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RUNX2Q13950 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms