Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNB1Q02641 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms