Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIP4Q15650 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIP4Q15650 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms