Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SCARF1Q14162 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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