Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF2Q12933 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRAF2Q12933 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms