Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F1Q01094 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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E2F1Q01094 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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E2F1Q01094 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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E2F1Q01094 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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E2F1Q01094 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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E2F1Q01094 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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E2F1Q01094 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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E2F1Q01094 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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E2F1Q01094 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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E2F1Q01094 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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E2F1Q01094 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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E2F1Q01094 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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E2F1Q01094 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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E2F1Q01094 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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E2F1Q01094 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F1Q01094 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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