Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRHP20396 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRHP20396 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRHP20396 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRHP20396 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRHP20396 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRHP20396 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRHP20396 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRHP20396 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRHP20396 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRHP20396 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRHP20396 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRHP20396 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRHP20396 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRHP20396 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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