Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP9-8Q9BYQ0 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms