Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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SCARB2Q14108 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
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SCARB2Q14108 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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SCARB2Q14108 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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SCARB2Q14108 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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SCARB2Q14108 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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