Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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CCINQ13939 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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CCINQ13939 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCINQ13939 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCINQ13939 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCINQ13939 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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CCINQ13939 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCINQ13939 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCINQ13939 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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CCINQ13939 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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CCINQ13939 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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CCINQ13939 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCINQ13939 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCINQ13939 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCINQ13939 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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CCINQ13939 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCINQ13939 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCINQ13939 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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