Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IKZF1Q13422 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms