Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KLF1Q13351 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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