Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CCINQ13939 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCINQ13939 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCINQ13939 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCINQ13939 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCINQ13939 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCINQ13939 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCINQ13939 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCINQ13939 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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CCINQ13939 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCINQ13939 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCINQ13939 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCINQ13939 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCINQ13939 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCINQ13939 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCINQ13939 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
CCINQ13939 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCINQ13939 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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